京都の薬師霊場巡りは平安時代から行われ、「薬師十二所参り」、「都十二薬師」、「洛陽十二薬師」などとも呼ばれていました。
時代により変遷はありましたが、江戸時代の天明年間(1782~1788)に現在の十二箇寺が定まったとされています。
天明3年3月12日(1783年4月13日)の岩木山に続き、同年7月6日(8月3日)に浅間山が噴火し、農作物に壊滅的な被害をもたらしました。
全国的に大飢饉が発生し、餓死とともに疫病も流行し、その死者数は数万人とも伝わります。
薬師霊場巡りが盛んとなった背景には、この大飢饉が関係しているのかもしれません。
霊場会としては約80年の中断の後、平成24年(2012)5月12日に復興されました。

第一番 平等寺 因幡薬師(いなばやくし)
住   所:〒600-8415 京都市下京区烏丸松原東入る因幡堂町728
電話番号:075-351-7724
納経時間:9:00~16:00
公共交通:地下鉄「四条」または「五条」駅からそれぞれ徒歩約5分
年間行事:毎月8日 薬師護摩、因幡薬師手作り市
        毎月12日 薬師経奉読
        1月1日 元朝護摩
       2月3日 万灯会、北斗護摩祈願
         4月8日 花御堂灌仏
         8月第一土曜日 盂蘭盆、施餓鬼会
         9月彼岸頃 神佛一体法要

第二番 教王護国寺(東寺) 金剛薬師
住   所:〒601-8473 京都府京都市南区九条町1
電話番号:075-691-3325
納経時間:8:00~17:00(受付は16:30まで)
公共交通:近鉄「東寺」駅から徒歩約10分
         京都駅八条口から徒歩約15分
年間行事:毎朝6時 生身供 御影堂での朝のお勤め
         毎月1日 大般若経祈願会
         毎月20日 御逮夜法要
         毎月21日 御影供 弘法市
        1月1日、2日、3日 新春祈願
        1月1日~3日 新春護摩
        1月3日 修正会
        1月8日~3月18日  五重塔初層公開
        1月28日 講堂修正会
        2月3日 星供
        2月15日 涅槃会
        3月15日 人類平和、地球安泰祈願会
        3月20日~5月25日 宝物館春の特別展
        3月彼岸期間中 彼岸会
        4月第一日曜日 献米法要
        4月15日 布薩法要
        5月3日 稲荷還幸祭
        5月15日 布薩法要
        6月15日 降誕会
        7月15日 布薩法要
        8月13日~16日 盂蘭盆会
        8月15日 万灯会、盆踊り
        9月15日 布薩法要
        9月20日~11月25日 宝物館秋の特別展
        9月彼岸期間中 彼岸会
       10月15日 布薩法要
       11月15日 八幡護摩供
       12月15日 布薩法要

第三番 水薬師寺 水薬師
住   所:〒600-8875 京都市下京区西七条石井町54
電話番号:075-313-0216
納経時間:10:00~16:00
公共交通:JR「西大路」駅から徒歩約12分
年間行事:1月8日 初薬師、本尊御開帳

第四番 壬生寺 歯薬師(はやくし)
住   所:〒604-8821 京都市中京区壬生梛ノ宮町31
電話番号:075-841-3381
納経時間:9:00~16:00
公共交通:阪急「大宮」駅から徒歩約10分
年間行事:1月1日 修正会
         2月2日~4日 節分会厄除大法会
         2月2日~3日 壬生狂言「節分」公開
         4月8日 花まつり              
       4月21日~29日 壬生狂言春の公開(有料)
        7月16日 新選組慰霊祭
        7月25日 大般若経転読法要
        8月9日~10日 盂蘭盆、精霊迎え火
        8月9日~16日 盂蘭盆、万灯供養
        8月9日 壬生六斎念仏法要
        8月16日 盂蘭盆、精霊送り火
        8月16日 壬生六斎念仏法要
       10月3連休 壬生狂言秋の公開(有料)
       12月31日 除夜の鐘

第五番 地福寺 日限薬師(ひぎりやくし)
住   所:〒602-8359 京都市上京区七本松通出水下ル七番町356
電話番号:075-841-7630
納経時間:
公共交通:JR「二条」駅から徒歩約15分
年間行事:

第六番 福勝寺 峰薬師
住   所:〒602-8359 京都市上京区出水通千本西入ル七番町323の1
電話番号:075-841-5818
納経時間:
公共交通:JR「二条」駅から徒歩約15分
年間行事:毎月1日及び16日は本堂等の自由参拝が可能(5:00~17:00)
         2月3日 節分会 昆布茶接待 お守り授与

第七番 雙林寺(そうりんじ) 東山薬師
住   所:〒605-0072 京都市東山区下河原鷲尾町527
電話番号:075-561-5553
納経時間:9:00~16:00
公共交通:京阪「祇園四条」駅から徒歩約15分
         JR「京都」駅、市バスD-2乗り場で206系統に乗車、「祇園」で下車し徒歩約10分
年間行事:毎月8日 薬師護摩
        1月1日 修正会
        1月1日~2日 新春護摩
        春分の日 彼岸会
        4月8日 花御堂灌仏
        8月15日 盂蘭盆、先祖回向法要
        8月18日 伝教大師童形像前勤行
        秋分の日 彼岸会

第八番 大超寺 鍬形薬師(くわがたやくし)
住   所:〒606-0024 京都市左京区岩倉花園町640-2
電話番号:075-711-3166
納経時間:平日の参拝は予約が必要
公共交通:叡山電鉄「八幡」駅から徒歩約10分
年間行事:

第九番 薬師院 不来乎薬師(こぬかやくし)
住   所:〒604-0014 京都市中京区釜座通二条上ル大黒町694
電話番号:075-211-1890
納経時間:
公共交通:地下鉄「丸太町」駅から徒歩約5分
年間行事:10月8日13時から薬師如来御開帳法要

第十番 大福寺 菩提薬師(ほていやくし)
住   所:〒604-0963 京都市中京区麸屋町通二条上ル布袋屋町498番地
電話番号:075-231-3624
納経時間:御朱印授与日時間帯不定のため、予約が必要
公共交通:地下鉄「京都市役所」駅から徒歩約10分
年間行事:

第十一番 西光寺 寅薬師
住   所:〒604-8047 京都市中京区新京極蛸薬師上ル中筋町495の1
電話番号:075-211-1938
納経時間:10:00~17:00
公共交通:阪急「河原町」駅から徒歩約7分
年間行事:

第十二番 永福寺 蛸薬師(たこやくし)
住   所:〒604-8046 京都市中京区新京極蛸薬師東側町503
電話番号:075-255-3305
納経時間:
公共交通:阪急「河原町」駅から徒歩約7分
年間行事:毎月8日 大般若会
        毎月24日 地蔵会
        1月1日 修正会
        1月8日 初薬師祈願会
        3月21日 春彼岸会
        4月8日 大般若会春大祭
        8月16日 盆施餓鬼
        9月23日 秋彼岸会
       10月8日 大般若会秋大祭
       12月8日 終薬師
       12月31日 大根炊き